货物由司机运输后数量不符，是否可以提起诉讼

您可以提起诉讼。根据《合同法》等规定，货物数量不符可依法追责。不及时处理可能导致证据丢失，权益难以保障。
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常见处理方式有调解和诉讼。建议先尝试调解，更高效且成本低；若调解无果，再提起诉讼以维护权益。
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可起诉。处理方式：1.调解，与司机协商，寻求快速解决方案；2.诉讼，收集证据，如货运单、盘点记录等，起诉至法院；3.无论选择哪种，均需保留好证据，以便后续维权。